Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1BQ00975 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms