Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK5Q00535 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms