Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD1P98174 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD1P98174 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGD1P98174 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGD1P98174 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGD1P98174 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGD1P98174 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGD1P98174 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGD1P98174 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGD1P98174 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGD1P98174 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD1P98174 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD1P98174 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD1P98174 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD1P98174 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD1P98174 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD1P98174 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms