Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP2P81877 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms