Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC1P78348 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms