Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRPAP78324 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms