Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms