Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms