Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCS1P62166 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCS1P62166 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCS1P62166 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCS1P62166 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCS1P62166 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCS1P62166 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCS1P62166 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCS1P62166 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NCS1P62166 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCS1P62166 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCS1P62166 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCS1P62166 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NCS1P62166 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCS1P62166 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCS1P62166 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCS1P62166 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCS1P62166 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NCS1P62166 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NCS1P62166 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCS1P62166 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms