Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms