Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms