Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms