Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX10P56693 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX10P56693 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX10P56693 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX10P56693 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms