Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FCGRTP55899 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FCGRTP55899 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms