Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL23P55773 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL23P55773 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL23P55773 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL23P55773 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL23P55773 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL23P55773 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL23P55773 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL23P55773 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL23P55773 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL23P55773 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL23P55773 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL23P55773 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL23P55773 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL23P55773 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL23P55773 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL23P55773 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL23P55773 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL23P55773 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL23P55773 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL23P55773 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL23P55773 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL23P55773 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL23P55773 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL23P55773 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL23P55773 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL23P55773 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL23P55773 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL23P55773 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL23P55773 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL23P55773 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL23P55773 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL23P55773 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL23P55773 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL23P55773 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL23P55773 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL23P55773 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms