Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLTPP55058 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLTPP55058 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLTPP55058 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLTPP55058 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLTPP55058 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLTPP55058 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLTPP55058 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLTPP55058 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLTPP55058 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PLTPP55058 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLTPP55058 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLTPP55058 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PLTPP55058 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PLTPP55058 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLTPP55058 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLTPP55058 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLTPP55058 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLTPP55058 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLTPP55058 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLTPP55058 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLTPP55058 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLTPP55058 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLTPP55058 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLTPP55058 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLTPP55058 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLTPP55058 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLTPP55058 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLTPP55058 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLTPP55058 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLTPP55058 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLTPP55058 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLTPP55058 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms