Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SMARCA4P51532 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms