Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV1P50549 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV1P50549 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV1P50549 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV1P50549 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV1P50549 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms