Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP4P49662 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP4P49662 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP4P49662 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP4P49662 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP4P49662 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms