Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTAP49354 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FNTAP49354 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FNTAP49354 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FNTAP49354 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FNTAP49354 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
FNTAP49354 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FNTAP49354 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTAP49354 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTAP49354 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTAP49354 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTAP49354 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTAP49354 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTAP49354 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTAP49354 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTAP49354 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTAP49354 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTAP49354 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms