Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA4P43681 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA4P43681 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms