Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTHFRP42898 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTHFRP42898 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms