Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 VTC1YER072W 390 nt2.93□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 PHD1YKL043W 1101 nt2.93□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 APC9YLR102C 798 nt2.93□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 YBL065WYBL065W 345 nt2.93□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 RGR1YLR071C 3249 nt2.93□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 GIS4YML006C 2325 nt2.93□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 FUN30YAL019W 3396 nt2.93□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 FLO5YHR211W 3228 nt2.93□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 INP2YMR163C 2118 nt2.92□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 SNQ2YDR011W 4506 nt2.92□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 MUK1YPL070W 1839 nt2.92□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 NOP10YHR072W-A 177 nt2.92□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 RSN1YMR266W 2862 nt2.92□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 PSK1YAL017W 4071 nt2.91□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 IKI3YLR384C 4050 nt2.91□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.91□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 AKR1YDR264C 2295 nt2.91□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 PXA2YKL188C 2562 nt2.91□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 TFC1YBR123C 1950 nt2.91□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 RRP12YPL012W 3687 nt2.9□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 FMP16YDR070C 282 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 snR52snR52 92 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 COS111YBR203W 2775 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 GRR1YJR090C 3456 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 YBR184WYBR184W 1572 nt2.9□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 YEL043WYEL043W 2871 nt2.89□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 RPS27BYHR021C 249 nt2.89□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.89□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.89□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.89□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.89□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 COX14YML129C 213 nt2.89□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 SGF11YPL047W 300 nt2.89□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 RIF1YBR275C 5751 nt2.89□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 FLO1YAR050W 4614 nt2.89□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 UBP14YBR058C 2346 nt2.88□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 RGA2YDR379W 3030 nt2.88□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 PFF1YBR074W 2931 nt2.88□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 RPS12YOR369C 432 nt2.88□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 SMY1YKL079W 1971 nt2.88□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 MPT5YGL178W 2580 nt2.88□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 CUL3YGR003W 2235 nt2.88□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 PMR1YGL167C 2853 nt2.87□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 PEP3YLR148W 2757 nt2.87□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 SWA2YDR320C 2007 nt2.87□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 NMD2YHR077C 3270 nt2.87□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 MAK21YDR060W 3078 nt2.87□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 NET1YJL076W 3570 nt2.86□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 SPO71YDR104C 3738 nt2.85□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 snR43snR43 209 nt2.85□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 TSC11YER093C 4293 nt2.85□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 DBP7YKR024C 2229 nt2.85□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 RCY1YJL204C 2523 nt2.85□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 DYN1YKR054C 12279 nt2.84□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 RIC1YLR039C 3171 nt2.84□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 ATG13YPR185W 2217 nt2.84□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 SUL1YBR294W 2580 nt2.84□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 MDM1YML104C 3384 nt2.84□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 HEH2YDR458C 1992 nt2.84□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 YNL114CYNL114C 372 nt2.84□□□□□ -1.95
YAR028WP39548 MOT1YPL082C 5604 nt2.84□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 TAE2YPL009C 3117 nt2.83□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 MMS1YPR164W 4224 nt2.83□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.83□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 YBR178WYBR178W 375 nt2.83□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 RPH1YER169W 2391 nt2.83□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 RRM3YHR031C 2172 nt2.83□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 BPT1YLL015W 4680 nt2.83□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 KAP123YER110C 3342 nt2.82□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 SNF5YBR289W 2718 nt2.82□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 ATG26YLR189C 3597 nt2.82□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 RPL23BYER117W 414 nt2.82□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 ULI1YFR026C 510 nt2.82□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 RPL20AYMR242C 519 nt2.82□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 TFC4YGR047C 3078 nt2.82□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 SIN3YOL004W 4611 nt2.82□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 CLN3YAL040C 1743 nt2.82□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 SPO22YIL073C 2928 nt2.82□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 SDC25YLL016W 3147 nt2.82□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 SWI6YLR182W 2412 nt2.81□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 DUG2YBR281C 2637 nt2.81□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 LRG1YDL240W 3054 nt2.81□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 TOR1YJR066W 7413 nt2.81□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 YOR218CYOR218C 420 nt2.81□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 FIR1YER032W 2631 nt2.81□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 STB4YMR019W 2850 nt2.81□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 STE6YKL209C 3873 nt2.81□□□□□ -1.96
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