Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPARGP37231 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPARGP37231 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARGP37231 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARGP37231 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARGP37231 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARGP37231 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARGP37231 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARGP37231 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARGP37231 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARGP37231 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARGP37231 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARGP37231 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARGP37231 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARGP37231 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARGP37231 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARGP37231 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARGP37231 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARGP37231 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARGP37231 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARGP37231 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARGP37231 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARGP37231 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARGP37231 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARGP37231 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARGP37231 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARGP37231 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms