Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms