Protein–RNA interactions for Protein: P36134

YKR041W, Uncharacterized protein YKR041W, yeastyeast

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR041WP36134 RPL42BYHR141C 321 nt0.82□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 CMS1YLR003C 876 nt0.82□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 RPL42AYNL162W 321 nt0.82□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YPL039WYPL039W 951 nt0.82□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YIR020CYIR020C 303 nt0.81□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 BRX1YOL077C 876 nt0.81□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 NUP145YGL092W 3954 nt0.81□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 SLS1YLR139C 1932 nt0.81□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 RRI2YOL117W 1938 nt0.81□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 DOP1YDR141C 5097 nt0.81□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 SCC2YDR180W 4482 nt0.81□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 ZRG17YNR039C 1818 nt0.8□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 SPT21YMR179W 2277 nt0.8□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 PIP2YOR363C 2991 nt0.8□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 SAG1YJR004C 1953 nt0.8□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 RTR1YER139C 681 nt0.8□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 LIN1YHR156C 1023 nt0.8□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 RPS18BYML026C 441 nt0.8□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 SWS2YNL081C 432 nt0.8□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YOL106WYOL106W 354 nt0.8□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 SAS3YBL052C 2496 nt0.79□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 GDS1YOR355W 1569 nt0.79□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt0.79□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt0.79□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YLR255CYLR255C 354 nt0.79□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 PKR1YMR123W 369 nt0.79□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 RPB11YOL005C 363 nt0.79□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt0.79□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YGR130CYGR130C 2451 nt0.79□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 KAP120YPL125W 3099 nt0.79□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 IFH1YLR223C 3258 nt0.79□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 AIM44YPL158C 2277 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 EAF1YDR359C 2949 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 PAU2YEL049W 363 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 ACF4YJR083C 930 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 CMC1YKL137W 336 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 DDR48YMR173W 1293 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YNL150WYNL150W 408 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YCL046WYCL046W 324 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 YCL020WYCL020W 1317 nt0.78□□□□□ -2.28
YKR041WP36134 ZIP1YDR285W 2628 nt0.77□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 CDC39YCR093W 6327 nt0.77□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 VMA7YGR020C 357 nt0.76□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 YLR217WYLR217W 324 nt0.76□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 YCS4YLR272C 3531 nt0.76□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 NOC3YLR002C 1992 nt0.76□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 NUP120YKL057C 3114 nt0.75□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 TOF2YKR010C 2316 nt0.75□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 SMD3YLR147C 306 nt0.75□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 IRC23YOR044W 474 nt0.75□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 ATP20YPR020W 348 nt0.75□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 RIM20YOR275C 1986 nt0.75□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 PXA2YKL188C 2562 nt0.74□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 HDA3YPR179C 1968 nt0.74□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 IRR1YIL026C 3453 nt0.74□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 STB6YKL072W 2301 nt0.74□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 SMB1YER029C 591 nt0.74□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 SEC28YIL076W 891 nt0.74□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 YBL062WYBL062W 381 nt0.74□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.73□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 PAU18YLL064C 363 nt0.73□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 PAU6YNR076W 363 nt0.73□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 snR14snR14 160 nt0.73□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 MPT5YGL178W 2580 nt0.73□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.72□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 TAD1YGL243W 1203 nt0.72□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.72□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 CDC24YAL041W 2565 nt0.72□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 SIP4YJL089W 2490 nt0.72□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 UTP13YLR222C 2454 nt0.72□□□□□ -2.29
YKR041WP36134 APL3YBL037W 3078 nt0.71□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 snR79snR79 84 nt0.71□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 YDR250CYDR250C 276 nt0.71□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.71□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 YHL037CYHL037C 402 nt0.71□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 YPR147CYPR147C 915 nt0.71□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 VPS52YDR484W 1926 nt0.71□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 AIM9YER080W 1884 nt0.71□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 SWI5YDR146C 2130 nt0.7□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 SNO3YFL060C 669 nt0.7□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 YFR057WYFR057W 456 nt0.7□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 RSM27YGR215W 333 nt0.7□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 YAP3YHL009C 993 nt0.7□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.7□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 RPL16AYIL133C 600 nt0.7□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 YKL111CYKL111C 336 nt0.7□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 SNO2YNL334C 669 nt0.7□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 YBR012CYBR012C 420 nt0.7□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 CYC7YEL039C 342 nt0.69□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 NBL1YHR199C-A 222 nt0.69□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 YML003WYML003W 873 nt0.69□□□□□ -2.3
YKR041WP36134 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.7 ms