Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPB2P35606 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPB2P35606 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPB2P35606 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPB2P35606 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPB2P35606 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COPB2P35606 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPB2P35606 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPB2P35606 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPB2P35606 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPB2P35606 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPB2P35606 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPB2P35606 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPB2P35606 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPB2P35606 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
COPB2P35606 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
COPB2P35606 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms