Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms