Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HTR1BP28222 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR1BP28222 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms