Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMB9P28065 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms