Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARK3P27448 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARK3P27448 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARK3P27448 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARK3P27448 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARK3P27448 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms