Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCM3P25205 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCM3P25205 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MCM3P25205 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCM3P25205 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCM3P25205 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCM3P25205 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCM3P25205 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCM3P25205 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCM3P25205 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCM3P25205 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCM3P25205 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCM3P25205 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCM3P25205 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCM3P25205 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCM3P25205 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCM3P25205 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCM3P25205 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCM3P25205 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCM3P25205 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM3P25205 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM3P25205 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM3P25205 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM3P25205 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM3P25205 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM3P25205 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM3P25205 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM3P25205 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM3P25205 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCM3P25205 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM3P25205 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM3P25205 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCM3P25205 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCM3P25205 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM3P25205 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM3P25205 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCM3P25205 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM3P25205 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM3P25205 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCM3P25205 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms