Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms