Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRZ1P23471 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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PTPRZ1P23471 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRZ1P23471 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRZ1P23471 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRZ1P23471 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRZ1P23471 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRZ1P23471 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTPRZ1P23471 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTPRZ1P23471 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTPRZ1P23471 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRZ1P23471 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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