Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRBP23467 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRBP23467 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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