Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms