Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT1P21579 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT1P21579 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT1P21579 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT1P21579 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT1P21579 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms