Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNA2P20248 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms