Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD53P19397 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD53P19397 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD53P19397 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD53P19397 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD53P19397 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD53P19397 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD53P19397 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CD53P19397 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD53P19397 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD53P19397 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD53P19397 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CD53P19397 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD53P19397 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD53P19397 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD53P19397 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD53P19397 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD53P19397 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD53P19397 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD53P19397 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD53P19397 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD53P19397 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD53P19397 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD53P19397 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD53P19397 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD53P19397 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms