Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZSCAN20P17040 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSCAN20P17040 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms