Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABRA1P14867 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA1P14867 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms