Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI4P10075 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI4P10075 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms