Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM6P0DI80 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms