Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB7P09629 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB7P09629 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB7P09629 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB7P09629 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB7P09629 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB7P09629 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB7P09629 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB7P09629 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB7P09629 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB7P09629 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB7P09629 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB7P09629 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms