Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IGKV1-5P01602 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-5P01602 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms