Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP1P01033 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP1P01033 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms