Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13A1P00488 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13A1P00488 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13A1P00488 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
F13A1P00488 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
F13A1P00488 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13A1P00488 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13A1P00488 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13A1P00488 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F13A1P00488 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F13A1P00488 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F13A1P00488 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
F13A1P00488 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
F13A1P00488 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F13A1P00488 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F13A1P00488 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F13A1P00488 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F13A1P00488 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F13A1P00488 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F13A1P00488 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F13A1P00488 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F13A1P00488 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F13A1P00488 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F13A1P00488 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F13A1P00488 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F13A1P00488 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
F13A1P00488 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
F13A1P00488 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F13A1P00488 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F13A1P00488 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F13A1P00488 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
F13A1P00488 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms