Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4FO95754 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4FO95754 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4FO95754 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4FO95754 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4FO95754 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA4FO95754 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4FO95754 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms