Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms