Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF4AO95239 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms